1 YoutubeはIPv6に対応してるんだからv6アルファ使うまでもなくフレッツのv6申し込むだけで解消する
2 フレッツサービスの回線速度測定はNTTの網の中、プロバイダにつながる前の
  速度を測るのでプロバイダの規制は関係ないはず(古い認識だったらごめん)
3 ボトルネックがある理由はNTTが装置の増設を絞ってるから
  マンションタイプが戸建てと違って混雑するのは、分岐に使ってる終点端末装置?がしょぼいらしいから
  戸建ても分岐は同じ数あるので、程度は違えどボトルネック自体は存在する

このスレの流れ見てる感じ、ルーターくさいな
まだ届いてないから設定項目見てないけど、そのへん何もいじれないの?