10月になって意図せず暇になったので、家のネットワーク環境を最適化しようといろいろやってみましたが少々失敗しました。
ハマりましたが、一応解決済です。似たような状態に陥っている人は潜在的に多いのではと思います。

プロバイダso-net HGW:RT-5000KI WiFiルーター:Buffalo WSR-1166DHP2
1)夜になるとネットが遅くなるのでIPv6に移行しようと思い立ち、HP上でv6プラスを申し込む。
2)以前、ギガを申し込んだ際にwifiルーター持っているにもかかわらず、NTTにwifi付プランを申し込んでしまいずーっと300円余計に払い続けていたのを思い出し、NTTにwifiカード返すと電話したらHGWごと返却するように言われる。
3)10/7 v6プラス開通
4)10/8 NTTから返却袋が来たので郵便局へHGWを返却
5)WSR-1166DHP2はv6プラスに対応してないのがわかり、WSR-1166DHPL2に買い替え接続、PPPoE設定しないと繋がらないので疑問を持ちだす。
6)so-netのサポートページによりIPv6には接続できているがIPv4 over IPv6ができていないことが判明。
https://support.so-net.ne.jp/supportsitedetailpage?id=000013894
7)BUFFALOのサポートページに従いv6プラス回線に接続しようと何度も試みるが失敗。
https://www.buffalo.jp/support/faq/detail/16422.html
8)6のページの「ホームゲートウエイからブロードバンドルーターへ切り替えの場合」を開いてみると、解約情報の移行に時間がかかるため、一旦v6プラスを解約し、HGW機能停止後32日以降にv6プラスの再申し込みを行えとの記載あり。サポートにチャットで確認するとやはり11/9以降に再申し込みせよとのことでした。

どういう仕組みかわからないですが、HGWが絡んでいるとは思いませんでした。
もう少し頭に血が上ったら過去ログで評判の悪いWSR-1166DHPL2を上位機種に買い替えるところでした。
v6プラスは来月中旬までお預けです。