市販ルータのWAN端子と(ブリッジモードにした)RT100のLANポートを繋ぐじゃないですか
そのRT100のLANポートは全て同じ扱いだから、残りのポートをどうするとか出来ない

RT100のLANポートを使う、の意味がよくわからないけど、
そこに市販ルータのLANポートからのケーブルを指したら市販ルータから見れば配線がループしてることになる
RT100のLANポートに市販ルータ以外の機材を並行して繋げても、その機材は市販ルータの管理下にないのでそのままではインターネットには繋がらない
例えばPCをRT100のLANポートに直結して(PCに)PPPoEの設定をすればインターネットに繋がるけど、ルータと同時に繋ぐこと(マルチセッション)はeo光では出来ないはず