色々教えていただきありがとうございます。
工務店に確認したら入線箇所（軒天）からONU設置予定の書斎まで光ファイバー用の配管が通っていました。先日工事の下見に業者が来ていたそうで工務店が配管経路についても話して了承もらったそうなので多分大丈夫なのかなと思います。