実運用上は、そんなエンコーディングの都合よりもftpdの文字化けで困るんだよね。
こればっかりはクライアント側の問題だからサーバ側ではどうにもならないし。

将来的にutf-8に統一されるなら今更eucJP使いたくないけど、
上記の理由で1台はeucJP確実なので、他も統一しないと使い勝手が悪い。
→全てeucjpで稼動。