.emacsはいじった？
(set-language-environment "Japanese")
(prefer-coding-system 'utf-8-unix)
(set-keyboard-coding-system 'utf-8-unix)
(set-terminal-coding-system 'utf-8-unix)
くらいは変更しないといけないと思う。
(set-buffer-process-coding-system 'utf-8 'utf-8)
もかな。