アクセス権限を保持しながらローカルにバックアップ、
もしくはアップロードした際にアクセス権限を再現して
展開できるようなツールはありますか？

バックアップはしているのですが、毎回再アップロード
時にファイルを一個ずつ権限を指定するのが大変です。
きっと初歩的な問題だと思うのですが、分からずじまい
なので先輩方にお聞きします。