flashplayer-pluginのinstall_flash_player_10_linux.tar.gzのチェックサムが違っていませんかね?
それともファイルが差し変わったのでしょうか?

FSはext3ですけど、svnでSTABLE_5を更新した後とかに
ファイルが数個しかない別ディレクトリでlsとかすると、一時的に反応がなくなるときがあるのですが、
FSが関係しているのでしょうか。
XFSでもなったかもしれませんが、今はext3にしてしまっているので比較できません
SATAの環境です