ゴメン嘘ついた。
GMTとUTCを混同してた。

UTCを基準にした場合、日本標準時は9時間進んだ状態になる。
システムクロックをUTCにした場合、自動的に9時間プラスされた時間が使用されることなり、タイムスタンプの関係で誤動作を起こす。
システムクロックにUTCを使用のチェックを外せば、この現象を回避できる。
UTCのまま使うと、未来に作られたファイルを修正したりというおかしな現象が起こる。
ということで、システムクロックはUTC+9(JST)にしなければならず、そのためにはシステムクロックにUTCを使用のチェックを外す必要が出てくる。