zipは比較的短期間に破られる。
TrueCryptが便利だと思うんだが、それは開発終了ということで VeraCrypt とか CipherShed を使うとかどうよ。
俺はLinuxでencfsとgpgと独自暗号化してるけどWindowsでやるより安心感高い。それにWindowsよりも高速。