色々弄った結果、落ち着いたのはこんな感じかな。

俺のマウスは左右とホイール以外に、横に3つボタンが並んでるんだが

手前:透明度UP
中:Scale
奥:透明度DOWN

って感じで設定した。
ウィンドウが重なった時に、何気に透明度が便利。
例えば2chだとログの上に書き込み窓をちょっと透明にして置いたりする。

それからAlt+Tabか、または画面下でホイール回すとRingSwitcher。
Scaleと違って、最小化したウィンドウも挙げるようにしてるな。
ウィンドウが無いと、ViewportSwitcherが発動してしまうがw

全体的にアニメーションはサクサク高速に、操作をほとんど阻害しないように。
RingSwitcherに至ってはアニメーションすらしない。