>>67
それはcompizが起動する前にconkyが自動起動するとなるらしいです。
なので実行ファイルを別に作って、その中でconkyの起動開始を遅らせると
うまくいくかと思います。

たとえば以下のようなもの

#!/bin/sh

sleep 30
/usr/bin/conky &


こんなのをつくってconky_BATとか名前つけて
自動起動させればうまくいくのではないでしょうか？