最近はubuntuを使うことが多くてkaliはあまり使ってないんだけど（steamのゲームが動かないから）、お気に入りは、

aircrack-ng：色々できる便利ツール群
cowpatty：wpaをレインボー攻撃
pyrit：GPUでWPAを攻撃
mdk3：ルータにDOS攻撃したり偽ap立てたり
karmetasploit：偽APに接続してきた奴を攻撃
wireshark：パケットを確認

ophcrack：windowsXPとvistaのログインパスワードを解析
crunch：ランダム文字列の辞書ファイルを作成
johntheripper：パスワードアタック
hydra：同上
medusa：同上
ncrack：同上
metasploit：有名なアレ

photorec：消去されたデータを強力に復元
truecrypt：HDD暗号化
gparted：パーティーション管理ツール