カーネルの機能に依存したものでコンテナで動かすようなものは
殆ど無いので気にしなくて良いのではと思います。

リスクとしてあるのは当然だが、それが問題となるような人はわかってる人か
アプリケーションコンテナでやるようなことではないことをやろうとしている
まったく分かってない人なので無視したほうが良い気がします。

たまにこれを Docker の問題とする人がいますが、具体的に何をする場合に
問題に成るのか正直わかりません。kernel の version や config が違うから
問題と成るアプリケーションは殆ど無いです。

例として、nvidia-docker などはホストの kernel（というかdriver）に依存するような気がしますが
これはそれなりにわかってる人が触るものですし、提供側も driver と docker command までを
セットで提供しているようなのでかなり特殊です。