HDDにXP/7/Linux Mintがある状態でWindowsブートマネージャを使う環境でテストしてみた
ブートローダーのチェックを外してインストール完了後に再起動したら…

W　i　n　d　o　w　s　ブ　ー　ト　マ　ネ　ー　ジ　ャ　消　し　や　が　っ　た

要するにブートローダーのインストールの有無に関わらずブートセクターは掃除されてしまう
チェックを外してインストールした場合、ブート可能なローダーがないとBIOSに怒られる結果となる

心臓停まるかと思ったがインストールDVDを使ってあっさり復活出来た。勿論HDDのデータは無事
Windowsとのマルチブートを考えている人は回復手段が判る人以外現時点では回避推奨

因みにManjaroのパーティションにGRUB2強制インストールしたけどCUIしか出てこなくて
結局単独でのログインは出来なかった