Ubuntuのnumpyは4 core cpuの全部のcore使って並列計算してくれるっぽいが
Gnetooのnumpyは1 coreしか使ってくれな

単にlapackのコンパイルオプションが違うだけ?
ちゃんと設定すれば4 core全部使ってくれる?