HDDからファイルをコピーすると速度が低下します。
症状としては、コピー開始直後は40000KB/sくらい出るのですが、しばらく経つと徐々に速度が落ち、最終的に330KB/sくらいになります。
逆(問題のHDDへの書き込み)は正常です。

他のPCにSSHでファイルをコピーしたり、SSHを使わずにHDDからUSBメモリにコピーしても症状が発生します。
SATAケーブルやHDDを交換しても変化はありませんでした。
OSをインストールした直後は正常なのですが、ディスク使用量が増えると遅くなるようです。

これはマザーボードが悪いのでしょうか？
環境は下記の通りです。
ディストリ:Ubuntu 16.04 64bit
HDD:WD10EADS-22M2B0 WD20EARX-00PASB0(交換しました)
ファイルシステム:ext4、XFS(フォーマットし直しても症状が現れました)