>jd.shの中身を編集した？
jd本体と2chproxy.plのパスは合ってる？
これが間違ってたら起動しないよ？
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#!/bin/sh
# last updated : 2017/05/01 12:26:55 JST
#
# 2chproxy.pl を起動してからJDを起動する。
#

# 2chproxy.plの場所をフルpathで書く。
PROXY="$HOME/bin/2chproxy.pl"
# JDの場所
JD="/usr/bin/jd"
# 設定ファイルの場所。使わなければ放置で。
CONFIG="$HOME/.2chproxy.yml"

if [ -f ${PROXY} ]; then
if [ ! -x ${PROXY} ]; then
echo "${PROXY} に実行属性が付与されていません。chmod +x して付与してください。";
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># JDの場所
JD="/usr/bin/jd"

コレが違うような

＞echo "${PROXY} に実行属性が付与されていません。chmod +x して付与してください。";
この言葉も気になる

過去スレそのほか読んでみます