LinuxのFlashはNPAPIのバージョンはVer.11のまま長らく放置されてて、最近になってVer.24にアップデートされて、今は27になってる。
放置されてた時期は、確かに艦これ動かない時期があったけど、その時もChromeのPPAPIのFlashは逐次アップデートされてて、それで普通に動いた。

というわけで、Linuxでも艦これが出来なかった時期というのは殆どない。
まあ、Windowsに比べてアクセラレーションがうまく使えてないんで、やや重かったけどね。