>>850
検索してみた限りだと他にも同じ症状が出てる人いるみたいですね
http://toxweblog.toxbe.com/2017/10/01/ubuntu-no-icon-menu/
https://qiita.com/kjunichi/items/1746796c0990b8f5356a

Ubuntu日本語フォーラムにもそれっぽいのが
https://forums.ubuntulinux.jp/viewtopic.php?id=19021

Compiz関係っぽいですけど私は詳しくないのでなんとも…