それは無視して良いエラーだと思う、たしかgithubでフォークしてメンテしてる人のリポジトリのJDだとエラー消す修正されてた

個人的には根本原因が気になるから追いかけてみて欲しいなぁ
デバッガ使えるならそっちで、あるいはjd.confの問題起きる方と起きない方の差分を見てみるとか