>>819-821 皆さん、ご助言有難うございました。
何とかビルド出来ましたので、書き込みテスト。

[バージョン] 2.8.9-180424
[ディストリ ] Ubuntu 18.04.1 LTS (x86_64)
[パッケージ] バイナリ/ソース( <配布元> )
[ DE／WM ] MATE Desktop Environment 1.20.1
[　gtkmm 　] 2.24.5
[　glibmm 　] 2.56.0
[オプション ] '--with-native'
[ そ の 他 ]

git clone -b test --depth 1 https://github.com/yama-natuki/JD.git jd
cd jd
autoreconf -i
./configure --with-native
make CXXFLAGS+="-std=c++11"

これで、warning出ずに"jd"が出来ました。
共有ライブラリのままですが、端末からなら実行出来るのですね。
ファイラーのメニューからだと実行出来なかったので、前は駄目だと思っていました。

2chproxy.plも何とか導入して、Linux板は見られます。
でも、他の板は"Gone"だらけになって、見られる板が少ないです…