判定したいのが、ファイル名の文字コードなのか、ファイル内容なのかがわからないけど。
ファイル名だったら、
zipinfo -2 file.zip
で中身のファイル名がわかるから、それを判定するとか？
元のファイル名が上記コマンドで得られるかわからないけど。

ファイル内容であれば見るために一旦zipを展開しないと見れないので、
テンポラリディレクトリに展開してfileコマンドでみるとか、nkf -gで見るとかかな。