>>311
100%コマンドです。
Synapticsなどはあくまで見た目です。実務上はコマンドのほうが効率が良いですし、トラブルシューティングのときにも役立ちます。
Linuxのコマンドリファレンスなどがにありますし。
man [コマンド名]
で説明をしてくれます。
Synapticsの裏で動いているのはAPTです。

#単純なパッケージの削除
sudo apt remove [パッケージ名]
#削除したパッケージで使っていたけど、そのパッケージは削除済みで、要らなくなったパッケージたちの削除
sudo apt autoremove
# 設定ファイルとかそういうものも一緒に削除したいとき
sudo apt purge [パッケージ名]

ちなみに
sudo apt update で最新のパッケージ情報を確認し
sudo apt upgrade で確認した最新のパッケージにアップグレードしてくれます。また、旧いパッケージの削除が必要で、アップグレード保留になる場合もsudo apt full-upgradeでやってくれます。
基本的に、パソコン立ち上げたあと「sudo apt -y update && sudo apt -y upgrade」を実行すればパッケージは最新に保たれる訳です。