俺の言った事(をさらに馬鹿でもわかるように平易に書いてやると):
・HDD上に断片化が何十・何百と進行したMFTを持つディレクトリは、ただファイル一覧を取るだけでも明らかに低速化していることがわかる
・こういった著しく断片化の進行したMFTを持つディレクトリは、MFTエントリを先に作成してからファイル実体をコピーする高速コピーツール等を利用してコピーすると、断片化していたMFTが連続確保される

言っていないこと:
・MFTはあらかじめある程度の容量を持って確保されるが、それが不足すると随時追加される。この場合に連続したクラスタに確保できない場合は(できない事が多いので)断片化する。 ←言っていないが、前提として
・ファイルを作成するたびにMFTが断片化する ←上をナナメ読みして勝手に解釈した馬鹿の結論