どちらに軸足を置いているか次第ではあるけど
Windowsホストの場合はゲストOSとしてLinux入れてゲスト上で3Dアクセラレーション有効にしてもそこそこ動作するけど
LinuxホストでWindowsゲストだとWindowsのグラフィックはほぼ死ぬし
デスクトップ機なら気にしないけどノートPCでは省電力周りもWindowsホストでないとお話にならないので
思想・嗜好的な問題を別とすればWindowsホストでLinuxゲストの方がいいんじゃないかな