レスありがとうございます。KDEは重いという先入観があって避けてました。
KDEも検討してみようと思います。
現状で思いついた対策は
普段はgesture onで、
vlc、upplay、calibre4などgesture offでなければ使えないアプリを起動するスクリプトを書いて、
#!/bin/bash
xsetwacom --set "Wacom HID 4814 Finger touch" Gesture off
vlc $@
xsetwacom --set "Wacom HID 4814 Finger touch" Gesture on
といったスクリプトファイルをを.desktopに登録して使ってみました。
シングルタスクならこれでも行けそうなのでqtライブラリのバージョンが上がるのを待ちたいと思います。
ペンは絵書きではないのでメモを取るぐらいなのでXournal++というソフトを使っています。
筆圧も感知してくれて結構いいです。