ttps://user-images.githubusercontent.com/3357792/55123225-02301200-5102-11e9-9492-4bf32aeb895a.png

ExecutableをアプリA、アプリBで別々に
Wine Prefixは共通(.wineとか)
Prefix architectureを32bitに

そしたら、アプリA、アプリBそれぞれ起動できるし、32bitになると思うよ