MX と antiX には独自のUSB初期化ツールがあります。
USB Format は Gparted でエラー発生したフラッシュメモリでも正常に初期化してくれたので優秀だと思います。
以下、参考までにその時の出力ログを貼っておきます。

Starting /usr/lib/formatusb/formatusb_lib 'sdb' 'vfat' 'USB-DATA' 'defaults'
device is sdb format is vfat
label is USB-DATA
unmount partitions OK
hide disk from udev OK
primary partition table clear OK
iso-hybrid partition table clear OK
secondary partition table clear OK
refresh partitions info /dev/sdb
/dev/sdb: msdos partitions
refresh partitions info OK
unmount partitions OK
bytes 7918845952 limit 2147483648000
making new dos partition table
making new partition table OK
refresh partitions info OK
create new partition OK
refresh partitions info OK
formatting partitions sdb1
unmount partitions OK
mkfs.fat 4.1 (2017-01-24)
format partition OK
unmount partitions OK
label partition OK
Device sdb
Refresh Partitions sdb
partition to mark 1
mark b