Windows9xにはDOS経由でディスクアクセスするモードもあるようだしコマンドプロンプト（仮想DOS窓とかいうらしい）はブートローダのはずのDOSを使ってるみたいだね。
DOS以外の「なにか」からWindows95が起動できるならDOSの上で動いてないって言ってもいいともうよ。
でもそんなことないよね。
やっぱりDOSの上で動いてるが正しいじゃん。