【1ボードPC】分散コンピューティング 2【コロナ】

このスレは、分散コンピューティングプロジェクトに参加し社会問題を解決する我らがチームのホームグランドです。
現在はRaspberry Piなどを武器にコロナと闘っています。


●rosettaプロジェクトにおける当スレチーム（[email protected]）の稼働状況
https://boinc.bakerlab.org/rosetta/team_display.php?teamid=19963

●BOINCプラットフォームのインストール、プロジェクト並びにチームへの参加方法などの基本事項は次のページにまとめてあります。
https://pastebin.com/X0auC92f

◯ゼロくらいから始めるBOINC
https://github.com/TamamoGozen/ZeroKurai

◯telegraf + influxdb + grafana
https://pastebin.com/xAjJh5Qj


＜関連スレ＞
【Raspberry Pi】ラズベリー・パイpart56【Arm】
http://mao.5ch.net/test/read.cgi/linux/1591042430/

・【BOINC】余ったPCで分散演算処理【Linux】
https://mao.5ch.net/test/read.cgi/linux/1351064171/

・【Team 2ch】分散コンピューティング総合321【UD→BOINC】
https://matsuri.5ch.net/test/read.cgi/entrance/1587083021/

Folding@Homeで難病解明 Part13【FAH】
http://medaka.5ch.net/test/read.cgi/pc/1592028195/

>>185
132位↑

おはよー
近頃fold等しょっぺえタスクしか降ってこないのでno more taskにして次の大波に備える作戦実施中

>>181 ですが、早速のご質問ですみません

BOINCManager上でRosettaをWCGと並走させ始め
昨日見たら積んであるRosettaタスクを押しのけて
新しいWCGタスクをやり始めてるようなんですが
複数プロジェクトのタスク配分を自動でうまく制御
できる方法ってありますか？

手動でRosettaタスクに切り替えてみるといつのま
にか途中で実行待機になっていたりで...

https://i.imgur.com/fvZg7sn.png

>>190
ありがとうございます。設定変えて走らせてみます

>>186
133位↓

タスク一覧を見たらfoldだらけだったので
ついカッとなって全部Abortして、WCGをAdd projectした。
後悔はしている。もっと早くやるべきだったと。。。

>>193
ちょっとあんまりな感じですよね
allow new tasks にした途端まだfold&炉端焼祭りですもの

裏を返せば色々実験出来るゆとり期間とも言えますな
WCGしかり、私みたく(演算用途としては)奇特なOSの試用しかり

>>192
135位↓

ぎりぎり銀バッヂ

いつになったらfold祭は終わるのか…

そう言えば新メンバーさん、いらっしゃいましー

>>196
foldということは、タンパク質の立体構造の組立作業（folding）なんだろうかな。
最安定の原則にしたがって少しずつ蛋白の構造を変えながら然るべき構造を見つけている。
われわれに配れているのは、多分、ターゲットタンパク質の部分的な箇所のfoldタスクなんだろう。

4B8gb+RpiOS64bitβで数日動かしましたがメモリはあまり使わないんですね
専用機にするなら4gbでよさそうでしょうか
WCGがまだ気を抜くとうまく動きませんがゆとり期間になんとかできればと

>>195
136位↓
銅バッヂ。

>>199
そうですね。
tmpfsとかで高速化するなら8GBのほうがいいと思いますが
普通に動かすなら4GBでいいと思います。
2GBだと2スレにしないとスワップしまくりですｗ

ちなみにWCGは1GBでも大丈夫です。
1GBモデルは4Bより前のモデルなので遅いですがｗ
（WCG専用で3B+を1.55GHzにして4スレで動かしていますが、1日かけて4タスクな感じ）
そして、4Bだと2GHzにオーバークロックしても
R@hほど高熱にはなりません（ヒートシンクやファンは必要ですが）。

>>201
ありがとうございます。安定運用するようになったら4B4gbをNASからひっぺがすことにします
アレもメモリ全然使わないし2gbあてがえばいいだろうと思っていたので
2gbでも買うとなると何でこんなにいっぱい持ってんの、をまた自問自答することになりますけどw

サーバの状態
As of 23 Jul 2020, 3:01:15 UTC [ Scheduler 稼動中 ]
Total queued jobs: 15,636,680
In progress: 681,906
Successes last 24h: 523,135
Users (last day ): 1,361,005 (+64)
Hosts (last day ): 3,502,940 (+8480)
Credits last 24h : 99,717,711
Total credits : 105,835,565,295
TeraFLOPS estimate: 997.177


TeraFLOPS estimate: 997.177
これ処理能力落ちてる？
以前もっと高かったように思うんだけと。

>>203

>>12 だと
TeraFLOPS estimate: 638.222
ですね。

>>202
目安はきりのいい数字ということで、4GBを8台、2GBを8台、とかでしょうか。
いえわたしはまだそこまでいってませんよほんとです

>>205
で、そこに8GBを投入してNFSサーバにしつつ
tmpfsで爆速演算と洒落込みましょうか

>>204
上がってるやん。
失礼しましたー！

>>202
2gとかだったらたくさん中古が出回ってそう。

>>208
引き出しにねむってる数は半端じゃないでしょうねー

>>200
137位↓
銅バッヂ
https://boinc.bakerlab.org/rosetta/top_teams.php?sort_by=expavg_credit&;offset=120

ひとつ上の136位は銀バッヂで、134-135位が銅バッヂ。133位から上はまた銀バッヂ。
こんなパターンもあるんですね。

>>210
まえは同じ順位があったよな。

Activin receptrollのタスクが美味しいけどレアタスク_(┐「ε:)_

>>210
133位↑
銀バッヂ復活。

foldタスクが消え始めたかも_(┐「ε:)_
ぼくはまだ5つぐらいfoldタスクあるんですけど( ˘ω˘ )

やっとスマホの回線から書けるぅ_(┐「ε:)_

grafanaがスマホでうまく表示されなかったものも修正されたようですー( ˘ω˘ )快適環境おかえりなさ

WCGのOpenPandemics - COVID-19で、サファイアのバッジをゲットー

>>214
こちらもやっと安定してきました。でも、まだちょいちょいfoldや炉端焼が忍び込んできていますw

>>216
おめでとうございます！あちらは粛々とCOVID-19タスクに専念できるのがいいですね。Rosettaにもあの仕組みがほしい〜

IBM様のおかげなんだろうね。毎日のWU数をグラフで表示してくれるのは便利。
でも、WCGは成果の宣伝が乏しいと思う。研究者にそれを期待するのは野暮とは分かるつもりだけど。
プロジェクトの進捗が見えるしくみがあるといいね。

>>213
131位↑

>>217
COVID-19しかやりたくない人はあっちのほうがいいですね。
必要なスペックも、メモリ250MB・ディスク100MBあればいいみたいですので、
SBCで参加できる人もR@hより多いんじゃないかと思います。
https://www.worldcommunitygrid.org/help/viewTopic.do?shortName=minimumreq

>>218
そうですね。
成果の宣伝が参加者の増加につながると思うんですけどね。

あっちの話題も、こっちで語ってもらって良いと思いますよ。
ロゼッタは、当スレチームが参加する一つだととらえられます。

参加用マニュアルはスレタイ用にほしいですけどね。
せっかくスレタイはモジュール形式になっていますし。

メモリ8GB機のメモリを余すところなく使ってみました
https://i.imgur.com/AWPNP9Y.png

>>219
129位↑
https://boinc.bakerlab.org/rosetta/top_teams.php?sort_by=expavg_credit&;offset=120

4BでRosetta@homeを実行してる。冷却ファンの異音が耳障りになってきたので止めてみた。
過熱してダメかと思ったら、65℃くらいで頑張ってる。ヒートシンクはアーマーケース。
自然対流でいけるならその方がいいのかなという気がしてきた。

>>223
126位↑

>>224
わたしは、アーマータイプヒートシンクの上に、
5V規格の小さいファン↓を3.3Vで動作させていますよ。
https://www.あまぞん.co.jp/gp/product/B07GFH8HF3

ほとんど風は感じないが、効果はあるみたい。
50度に保たれている。
3.3Vで動かしているのでほぼ無音なのが良い。

>>226
追加情報

Raspberry pi 4 (4GB)
3コア100％動作で、50度
4コア100％動作で、55度

$ vcgencmd measure_temp
temp=55.0'C

>>224
複数台ならでかいの使うのも悪くない
でかいファンは掃除がしやすい
http://akizukidenshi.com/catalog/g/gP-14358/

>>228
まとめて空冷するということ？

>>229
イエース
以下は使用例
https://m.imgur.com/a/PljHxGa

>>225
124位↑

>>230
ここまでモチ無しw

>>232
リーサルウェポンは万策尽きた時に引っ張り出します

次スレのテンプレにモチが採用されるフラグ?

boolean モチ=true

職場の電気が一瞬落ちてああ瞬電か…気になって自宅に繋いだら1台はセーフ、もう一台はNFSのコネクションが切れていてあぶないあぶない

>>236
釣りバカ日誌みたいだな

>>231
123位↑
https://boinc.bakerlab.org/rosetta/top_teams.php?sort_by=expavg_credit&;offset=120

またもやfoldフェスタが始まったようだ
だがこの低功績タスク、高功績タスクの部品みたいなものと解釈することにした

そう思わないと何か切ないのでｗ

ぼかぁいずれこの低功績が平均功績をプラスにしてくれると思って回してます(´°̥̥̥̥̥̥̥̥ω°̥̥̥̥̥̥̥̥｀)ずんずん減って1072までやだぁ

いんふらさんがないている

なにもしない
→なぐさめる

こちらはfp*（YYMMDDですかね）祭になっており、active_バブルは終わったようですね

日本時間、本日20時の記録

サーバの状態
As of 30 Jul 2020, 11:01:57 UTC [ Scheduler 稼動中 ]
Total queued jobs: 14,201,550
In progress: 692,415
Successes last 24h: 523,967
Users (last day ): 1,361,423 (+56)
Hosts (last day ): 3,577,281 (+8929)
Credits last 24h : 102,930,165
Total credits : 106,594,838,614
TeraFLOPS estimate: 1029.302

でも今円高だし……foldタスクが来るのも同じ理由だもん(´°̥̥̥̥̥̥̥̥ω°̥̥̥̥̥̥̥̥｀)

>>241
(*´∀`)♪

なぜかどんどん功績値が下がっていく。
なんの対策もしてないからか。

そういえば、新しい方が入られましたね。
よろしくどうぞ。

>>245
残念ながら只今低功績タスクラッシュ中につきほぼ不可抗力でござる...

新メンバーさん、宜しくお願いします。
一緒にゆるりと楽しみましょうｗ

>>238
123位→
かろうじてキープ。

またfold祭り。。。

>>247
125位↓

>>249
124位↑

>>243

As of 3 Aug 2020, 11:02:05 UTC [ Scheduler 稼動中 ]
Total queued jobs: 12,523,315
In progress: 706,603
Successes last 24h: 556,523
Users (last day ): 1,361,595 (+44)
Hosts (last day ): 3,616,794 (+7513)
Credits last 24h : 98,971,642
Total credits : 106,993,317,226
TeraFLOPS estimate: 989.716

やっとfold祭り終わったかな

>>251
As of 3 Aug 2020, 23:02:16 UTC [ Scheduler 稼動中 ]
Total queued jobs: 12,301,582
In progress: 712,205
Successes last 24h: 571,934
Users (last day ): 1,361,616 (+44)
Hosts (last day ): 3,622,372 (+7513)
Credits last 24h : 100,129,860
Total credits : 107,044,756,299
TeraFLOPS estimate: 1001.299

ぼく大量のfoldタスクを抱えて困惑(´・ω・｀)

最近降臨するタスクの俺的功績値評価

松：activin_receptorII*　cd86_design*
竹：tgfbR*　miniprotein_relax5*
梅：rb*

うんこ：JHR*fold*　*fold*　SL*abinitio*　fp*abinitio*

>>250
126位↓

>>255
松：
レセプターというからには、サイズが小さいんだろうな。
だから計算が早く済むとか？

梅：
アプイニシオというのは、「最初から」という意味で、
非経験的計算法というヤツだと思う。
すべてを計算で片付けようとするので計算量も多くなるはず。
処理が重たくなるだろう。

foldingも立体構造の探索だから処理重たそう。
クライアントあたりの処理量も多くなるんだろうな。

>>257
梅でなくて、運子だったな

>>257
高功績タスクは得てしてメモリ食いますな。
しょぼいのは大体その逆。
※梅に入れたrb*みたいな例外もあり

ハイパワーマシンを使わないと満足いく功績値がもらえないタスクもある中で、
*fold*や *abinitio*はどんなマシンでも(と言ってもラズパイやケータイｗ)高功績になったのを見た事が無い

なおどのタスクも所有時間はほぼ設定したターゲットCPUタイム通り。
功績値は時間内にいかに内容の濃い演算が出来たかによるのでしょう。

3月からの不審な咳と喉の痛みは胃下垂かもしれず改めて運動始めました(´・ω・｀)
アレルギー疑って部屋の乾燥疑って風邪やコロナ疑って見たけどなんかどれも違うっぽいなぁって思い始めてたらインナーマッスル衰えの運動不足でした
確かに逆流性食道炎の胃下垂だと喉痛めて咳出ますね………_(┐「ε:)_はぁ

( ˘ω˘ )医者にも言われたのですが細菌やウィルスで5ヶ月も感染し続ける病気なんてないので内科医も呼吸器内科医も首を傾げるわけです

というわけで時間かけて横隔膜付近のインナーマッスル鍛えます(´°̥̥̥̥̥̥̥̥ω°̥̥̥̥̥̥̥̥｀)

>>256
128位↓
https://boinc.bakerlab.org/rosetta/top_teams.php?sort_by=expavg_credit&;offset=120

>>261
逆流性食道炎ということは、
胃カメラで診てもらったんですかね

>>263
( ˘ω˘ )逆流性食道炎は胃になんか異物か傷があるか、とりあえず胃カメラ飲んで発覚したのですよ
肩こりとか腰痛酷いなぁ直したいなぁっていうのを対応してたら、対策の過程で今年までは症状はおさまってたのです

今年に入るまでは仰向けできちんと寝るようにしてたのですが、今年から横向いて寝ることが多くなって、あんまり良くないよなぁと思ってたら再発したようですね_(:3」z)_もともと姿勢が悪いのもありつつ、筋肉の衰えもあったのが拍車かけてるのです

>>264
逆流性食道炎ナカマです

私は自覚症状無くて、急に声が裏返ったりむせたりするようになって調べてもらったら喉に小豆くらいの出来物が見つかって「終わった」と思いました・・・

結局胃酸で粘膜がただれて出来物になっていただけだったのでホッとしましたが、今も一度風邪をひくと2ヶ月くらい咳が止まらないです（ステロイドで早めに止まるようになりましたが、それでも1ヶ月くらいは続く）。

私も運動しなきゃ。お互い用心しましょうねー！

fold・炉端焼祭が終わってほっとしました(*´ω｀*)

>>264
なるほど胃酸を抑える薬なんかも処方されるんですよね。

私も不快感から経鼻胃カメラして、逆流性食道炎の跡があるということで、
気持ち悪いときなどにはたまに薬飲んでいますよ。
一度症状を感じ始めるとしばらく治らないのが不思議です。

空腹にチョコレートが発症の引き金でした。
不摂生は駄目ですね。

>>265,266
ご参考までですがインナーマッスルと骨について密接に関連してるようで、めぐりめぐっての対策が整骨院だったのです_(┐「ε:)_

以下は長いのでお時間があるときにでも

最近の整骨院がどこまでインナーマッスル鍛えられるかちょっと場所によるのですが昨年まではインナーマッスル鍛える機械(高額&それなりに知識が必要)が販売されていたのですがシャッチョさんが突然連絡取れない状態になったとかで、通院先整骨院ではまだ利用できるので大丈夫とは言え、いつ利用できなくなってもおかしくないのである程度鍛えた今は自力でもやらないとなーってなってます

インナーマッスル鍛えてからは風邪もほぼ引かなくなり顔の歪みと体の歪みだったり昔のようにある程度落ち着き取り戻したり精神面肉体面である程度良い効果が出てるので、もし気になるよう症状があれば合わせてインナーマッスルと骨を調べてみると良いかも知れせん

長文すみませんｗｗｗｗ

まとめて言うと、もう酷いくらい身体がボロボロでとても書ききれないほどひどい状態だったですが今は全然平気なのでおきになさらずです(´・ω・｀)

>>262
127位↑

foldがちょっとカッコいい名前になって帰ってきた！
https://i.imgur.com/XABZITd.png

ヤダ！(´；ω；`)来ないで！

>>269
foldはなんで他のと間違えてもらえそうな名前に偽装するんでしょうねw

>>271
fold it !

>>269
BOINC Managerの機能をCUIで実行できるなんて知らなかった。
調べたら boinctui だね。さっそく動かしてます。情報ありがとう。

>>273
WindowsからでもWSL内にインストールすればラズパイにアクセス可能
細かい設定以外はGUIで出来る事は殆ど出来るのでマジ便利

>>268
124位↑

ログインするのも億劫だって人にはtelegrafとgrafanaとinfluxdbです(´・ω・｀)

BOINC Managerも、コマンドライン引数を与えると自動でログインしてくれるよ。

>>275
122位↑

>>278
119位↑
https://boinc.bakerlab.org/rosetta/top_teams.php?sort_by=expavg_credit&;offset=100

新しいページを開きました。

今度のfoldは地雷臭がプンプンするぜ
なんたって今までrb*しか来なかった3B+にも降ってくる位だからな
https://i.imgur.com/eUq3x3n.png

それよりページが変わっていよいよ２けたランキングが見えてきた。
人それぞれのやり方で、しかもほぼラズパイでゆるーくやってるのに。凄いことです。

>>280
なんというfold祭w w w

>>281
https://i.imgur.com/qxAx21B.png

腐ってやがる...(人様に電気代使わせるには)まだ早過ぎたんだ...
(どんなマシンでもこうなるとは限りません)

>>282
もはや罰ゲームw

>>279
やばい、二桁行く！

ドイツから参加くださっている方もおられるようです。
よろしくお願いします。

>>279
118位↑