なるほど。
つまり、全体として一つの目的を果たすアプリを構築するモノであって、細かいコンテナを結合して使うような形はあまり想定されていないと。
やる場合はdocker composeが一番イメージに近そう。
こちらの想定としては、例えばpython2の実行環境が本番で動いているとして、その周りの環境はそのままに、pythonを2から3の実行環境へと入れ替え（ここをコンテナの入れ替えをするイメージでした）して、実際に全体として動くのかと言うような形の検証が出来ればいいなと考えていました。
この場合、python3ではうまく動かないなとなれば、python2のコンテナにつなぎ直せばゴミも残らず即元通りになると思いましたので。