コンテナが動くマシンが決まりきってる、ってんなら仮想マシンで十分だ
EC2でもなんでもいいよ
普通にパッケージを入れて、普通にsystemdで動かしゃいい
dockerなんて余計なリソース食うだけ
仮想マシンなら、従来の管理ノウハウも役に立つ
コンテナを使うなら、クラスタが大前提