ファイルを消すのは、かなり危険な事だから、
余程、アプリ開発者が入念なテストを書いていないと無理だと思う

使っているファイルを消すと、リンク切れになる

例えば、Ruby on Rails では、selenium-webdriver, capybara で、headless Chrome を使って、
すべてのボタンなどを押して、すべてのユーザーアクションを自動テストでチェックする

普通、このテストコードは、アプリのソースコードの数倍以上ある。
それぐらい膨大だから、Google 以外の検索エンジンは、
後から読み込む、JavaScript(JS)・Ajax には対応しない

すべてのユーザーアクション・JSを実行させて、
それを反映した後のHTML を取得する必要があるから

自分がそのアプリのテストコードを書いていないのなら、やめておいた方が無難。
そのアプリの開発者しか、使うファイルを把握していないから

他人がアプリを分析するのが、極めて難しい