それはこれかと
> 一部setxkbmapしなおさないと反応しないキーがあった

setxkbmap -model pc105 -layout jp　を ~/.trinity/env/任意の名前　に記述し、
それでも駄目なら自動起動にも登録します
とりまkonsoleで手打ちすれば直る事を確認されると良いかと