GUIの要不要の問題じゃなく、Docker DesktopをLinuxに入れちゃうとWinやMacと同様にLinux VM上でコンテナ動かすことになり
本来不要なオーバーヘッドとシステムリソース消費が発生することになるから、
意図的にVMで動かしたいのでない限りはLinuxに docker入れる方法としてはむしろ完全に間違ったやり方よ