>>921
うちはDebianのVLCだけどインストール直後mp4の映像再生がおかしくて
ビデオの出力先が自動だったのを XVideo出力(XCB) に変更したら正常に再生されるようになった
そちらとは現象と原因が違うかも知れないけど

VLCの
[ツール]-[設定]-[ビデオ]タブの[出力]を
色々切り替えて表示できるか試してみてはいかが？

切り替えた後は「保存」ボタンを押して一旦VLCを終了させて開き直さないとならないかも