実行環境なんで複数持てるようにするのは当然だろう
ライブラリを複数バージョン持てるようにするのと同じだ

自分が明示的にインストールして
もういらなくなったのがあれば自分で消せばいい
apt系なら
apt-mark showmanual ’*llvm*’
で分かる