あんまり疑いたくないけど
リリースノート読んでそれに従って
アップグレードしましたか？
https://www.debian.org/releases/stable/release-notes/index.ja.html

apt のリポジトリ元の設定を書換えて
# apt update
# apt upgrade --without-new-pkgs
# apt full-upgrade
だけで以前の個別コマンドが全て不要なはずなんだけど…