一番気になるのは/パーティションしかないそうで
UEFIだと/boot/efi にマウントするはずのEFIパーティションの存在
旧BIOS仕様の仮想マシン？

trixiインストーラーで起動して修復機能がないかな？
あるいは全部手でやるなら
上記のtrixiインストーラーでシェルを起動
/recoveryroot/
とかマウントポイント作ってそちらに復旧対象のパーティションマウント
chroot /recoveryroot
したうえで復旧できるはずだが

がんばって