>>181 では逆にext3などのディレクトリーにツールでWinのドライブレターを割り当て
マイドキュンのリンク先をその中の（新しい）homeにする

だとパーミッションが問題になるんすか
homeのパーミッションを変えればイイのでしょうか

仮に出来てもWindowsが起動してからでないとドライブレター割り当て
ツールが起動しないから起動時エラーになるとか？