forceつけないとPBRにはインストールできないのが素のgrub2の動作だよね

一般的な話だけどインストーラをgrubをインストールしないで完了させて、再起動する前に
sda6を/mnt、sda5を/mnt/bootにマウントして
# grub-install --target=i386-pc --recheck --debug --force /dev/sda5
# grub-mkconfig -o /boot/grub/grub.cfg

で良いんじゃないかしら
各ディストロによる独自の変更は知らんからcentosで実際に出来るか、適切かどうかはわからんけど